Fortis Türkiye Kupası 2. kademe kura çekimi Ankara'da yapıldı. Ankara Swiss Otel'de gerçekleştirilen kura çekiminde Gaziantepspor'a Kayseri Erciyesspor çıkarken, Büyükşehir Belediyespor ise ligin güçlü ekiplerinden Vestel Manisa ile eşleşti. 26 Eylül'de başlayacak olan karşılaşmalarda Kırmızı-siyahlılar Kamil Ocak'ta oynayacak, Büyükşehir ise deplasmanda.
26 Eylül'de oynanacak 2. kademe kura çekiminde 2006-2007 sezonunda Süper Lig'de 5-15 arasında yer alan takımlar, TFF 1. Lig'den Süper Lig'e yükselen 3 takım ve ilk kademeden gelen 18 takımla birlikte toplam 32 takım yer aldı. 2. kademe maçları tek maçlı eleminasyon sisteminegöre oynanacak. Maçların normal süresinin berabere bitmesini durumunda uzatma dakikalarına geçilecek, yine eşitlik bozulmazsa penaltı atışlarına geçilecek.
Çekilen 2. kademe kurularına göre eşleşmeler şu şekilde oldu:
Gaziantepspor - Kayseri Erciyesspor
Vestel Manisaspor - Gaziantep Büyükşehir Belediyespor
Tepecik Belediyespor - Ankaragücü
Arsinspor - Denizlispor
Şanlıurfaspor - Konyaspor
Gençlerbirliği Oftaşspor - Uşakspor
Alanyaspor - Sivasspor
Kayserispor - Diyarbakırspor
Sarıyer - Kasımpaşa
Çaykur Rizespor - Eskişehirspor
Bursaspor - Boluspor
İstanbul Büyükşehir Belediyespor - Diyarbakır Büyükşehir Belediyesi DİSKİSpor
Ankaraspor - Kartalspor
Gençlerbirliği - Akçaabat Sebatspor
Adana Demirspor - Altay
MKE Kırıkkalespor - Sakaryaspor"
